基本學測的分數組距要不要公布，又引發爭議。近十年教改一路走來，定位不清，方向不明。實施時紛擾不斷，自可以預期。
「基本學測」的定位是「門檻」而非「甄別」，這事早就應該確定，不然何必大費周章廢除聯考？基本學測題目簡單，若用來甄別，會使學生無法以平常心對待，徒增考情炒作，有違教改旨意。基本學測應只有「及格」與「不及格」兩種成績。學生果具基本學力，不必準備，隨時去應考亦可及格。只設門檻不計以分數，考試壓力則不會緊繃，考情亦不易被大肆炒作。反之，以分數來甄別高低，則學生必須浪費精力去演練題庫中大量的考題，考試壓力暴增，基本學測用意盡失。
何況基本學測的題目，原本只為測出基本學力而設，無法細分學科實力高低。倘以其成績來加甄別，作為升學依據，亦有失真之嫌。尤其在台灣這種考試國家，所測結果將不是學科實力，而是考試能力。考量台灣特殊國情，基本學測不宜仿美國SAT或TOFEL用來甄別實力，其理至明。至於升學所需之進一步甄別，可採如下之方案。
基本學測及格者可申請進入高中職，不及格者得再繼續參加學測，直到及格為止。相應的，基本學測應該(1)經常施測：學生每月都可去報考，(2)分科施測：每次報考，學生可自選考試科目，考一至數門，及格科目成績保留三年，(3)小眾施測：分別委由具公信力之機構(包含國中本身)施測，全國施測機構可數以千計。如此，基本學測將大幅減輕學生考試壓力，考不及格還可以再考，國中三年內隨時可去報考尚未及格的學科。.
基本學測及格者申請進入高中職的方式是，參加升學考試或直接申請推甄入學。升學考試分兩梯次：第一梯次由招考學校自行命題，每位學生只能報考一所學校(可安排同一天考試)。經錄取者，便逕行入學，未錄取者才參加第二梯次考試。第二梯次由縣市高中職分別聯招。學生報考後依志願錄取。各校在第一梯次招生時，應保留至少一至二成之入學名額給第二梯次考生。至於直接申請推甄入學者，只需基本學力測驗及格與學校推薦書，不必再參加升學考試。